Haşarat:
- Soğan kurdu (Delia antiqua)
- Thrips (Thrips tabaci)
- Soğan sineği (Eumerus spp.)
- Kesici kurtlar (Agrotis spp.)
- Yaprak bitleri (Aphis spp.)
Mantarlar:
- Beyaz çürüklük (Sclerotium cepivorum)
- Tüylü küf (Peronospora yıkıcı)
- Pembe kök (Phoma terrestris)
- Fusarium bazal çürüklüğü (Fusarium oxysporum f. sp. cepae)
Virüsler:
- Soğan sarı cüce virüsü (OYDV)
- İris sarı nokta virüsü (IYSV)
- Soğan mozaik virüsü (OMV)
- Tütün çıngırak virüsü (TRV)
Diğer zararlılar:
- Nematodlar (Ditylenchus dipsaci)
- Soğan akarları (Rhizoglyphus spp.)
- Kemirgenler (tarla fareleri ve fareler gibi)
Bu zararlıların şiddetinin ve etkisinin, belirli bölge ve iklimin yanı sıra kullanılan yetiştirme uygulamalarına bağlı olarak değişebileceğini belirtmekte fayda var.